医疗保险通常会订明索偿期限，一般为求医／出院后的30至90天内。由于保险公司有权拒绝处理超过索偿期限的申请，受保人必须在索偿期限内向保险公司提出索偿申请，并递交相关证明文件。
部分保险公司会提供预先批核服务，由保险公司直接向医疗机构缴付费用，受保人毋须于出院时缴费。如欲申请此项服务，受保人须于入院前的指定工作天内向保险公司提出申请，并带同由该保险公司发出的「初步保障审核确认／付款保证信」办理入院手续。不过，投保人要注意，保险公司提供的预先批核服务及赔偿金额属评估性质，与最终的实际医疗费用或有差异，赔偿金额会以最终理赔为准。如有疑问，应向相关保险公司查询。
当申索赔偿额较低的医疗开支，例如门诊治疗时，一般只需要提交索偿表格、收据及转介信（如适用）的正本。部分保险公司亦会容许受保人以电子方式提交申请。如需申索住院的医疗开支，一般而言，必须提交以下文件：
假如需要向两间或以上的保险公司索偿，受保人入院时须请主诊医生分别填写不同保险公司的索偿表格，并请医院在不同表格上盖章。当向第一间保险公司索偿时，亦须向该保险公司要求取回收据正本或其核实副本，才可凭该收据正本或核实副本向另一间保险公司索偿。
不少人对保单上的「医疗需要」条款存在误解，以为只要经医生转介，便可以向保险公司申索住院赔偿。事实上，保单条款上的「医疗需要」，并非单纯取决于有关住院是否由医生推荐。不同保险公司对于「医疗需要」的阐释或有不同，但大致上都会考虑该病情是否危急、住院是否属紧急性质或具迫切性、住院是否为了进行医疗上必须的治疗或手术、有关治疗可否于门诊处理、是否在不住院的情况下难以进行、住院是否纯粹为了检查征状或病征而不作治疗等。
换言之，若有关治疗可以在门诊进行，或者住院期间没有接受任何治疗，保险公司便有可能拒绝住院赔偿。为免失去预算，受保人接受非紧急的住院服务前，应该先向保险公司了解清楚其保单的保障范围与不保项目。
不同医疗机构或医生就治疗相同疾病的收费，可能有明显差别。保险公司处理医疗索偿申请时，会以「合理及惯常」的医疗费用作为审批原则。一般而言，保险公司会参考各私家医院、医疗机构、医疗报告及索偿数据等资料去厘定赔偿额。换言之，假如索偿金额超出「合理及惯常」的医疗费用，保险公司未必会全数赔偿，受保人便需要自行支付超出赔偿额的开支。 为免在索偿时出现争拗，受保人在接受医疗服务前，不妨先比较不同机构或医生提供相同治疗服务的收费，或直接向保险公司查询该收费是否合理。
以上内容仅供参考，个别医疗保险计划的保障范围、赔偿方式、赔偿额及保费等，均以个别保单的条款为准。